Sjöhistoriska institutets arkiv är unikt och det är resultatet av ett insamlingsarbete som har pågått utan avbrott sedan 1930-talet. Fokus för insamlingsverksamheten har ända från början varit inställt på den finländska sjöfartsnäringens historia och på kust- och skärgårdsbornas näringar. Arkivet omfattar ca 900 hyllmeter handlingar som huvudsakligen berör handelssjöfart, fiske, båt- och skeppsbyggeri, sjöassurans och vattensport.
Samlingarna består av person-, rederi- och bolagsarkiv. Arkivalierna utgörs bl.a. av skeppsdagböcker, skeppsdokument, ritningar, sjökartor, korrespondens, fotografier, konst och ljudband.
Institutets arkiv har huvudsakligen kommit till genom donationer men också genom egen insamling, framförallt av traditionsmaterial.
Samlingen av skeppsdagböcker (i vardagligt tal loggböcker) är unik och den omfattar drygt 4 600 volymer, förda mellan åren 1758 och 2012.
Hos oss kan man bl.a. bekanta sig med följande ordnade och förtecknade rederi- och bolagsarkiv (omfattning i hyllmeter inom parentes):
- Andra sjöassuransföreningen i Finland (10 hm)
- Ångfartygs Ab Bore (100 hm)
- Finska Ångfartygsaktiebolaget, FÅA (150 hm)
- Meritoimi Oy (11 hm)
- Oy Ridal Ab (5 hm)
- Sjöassuransföreningen i Finland (55 hm)
- Sjömännens Ömsesidiga olycksfallsförsäkringsbolag (4 hm)
- Soini-rederierna (3,5 hm)
- Åbo Shipping Ab (2 hm)
- Ångbåts Ab Åland (12 hm)
- Ångbåts Aktiebolaget Södra Nagu (6,2 hm)
Sjökartssamlingen innehåller sjökort, kartor och atlaser från hela världen från 1500-talet till våra dagar.
Fotografisamlingen består av omkring 100 000 skärgårds-, fartygs-, båt-, person- och hamnbilder.
Arkivet innehåller vidare stora mängder båt- och fartygsritningar med en mängd olika konstruktörer och varv som arkivbildare. Bland representerade konstruktörer noteras bl.a. Birger Slotte och Hans Groop och bland varven exempelvis det namnkunniga Åbo Båtvarf.